1、个体户不享受到优惠政策，没有投资风险；个体户和有限公司都需每个月和报税，有限公司可以享受税收优惠政策。
2、个体工商户不可以申请税率为17%，只能申请小规模人3%。有限公司公司则可以申请到17%的一般人纳税人。
3、承担的法律责任不同
个体工商户如果做生意亏了本，你自己得对全部负责。有限责任公司如果做生意亏了本，可向申请破产保护，如你注册公司时的注册资本金为50万，而你欠别人200万元，你只需还50万即可，且受法律保护，别人是拿你没办法的。
4、税收计算方式不同
个体工商户一般是税务机关根据其所在位置\规模\员工人数\销售商品等等来估算你的销售额,然后再给定税.不论当月的收入多少，有无收入都要按定税金额来交税。
而有限责任公司则是通常要求企业必须核算健全,要有帐,交税也是根据企业自己申报的收入来交税,有收入就交，没有就不交。
个体工商户或个人独资企业的经营所得只缴个人所得税；有限责任公司的经营所得既要缴纳企业所得税，也要缴纳个人所得税。
个体工商户或个人独资企业的征税一般采取定额定率征收；有限责任公司的征税，营业交易环节按征税，经营所得环节一般采取核定征收或查帐征收两种方式。
5、个体工商户注册登记时无需公司章程，有限责任公司注册时则需要公司章程。